故事发生在被选召的孩子们首次接触数码世界的6年后。2005年的一天，东京港区海面上的波浪在朝阳下摇曳……17岁的高中生八神太一，如常地用手按停眼前的闹钟，踢开混乱的被铺，低声滴咕下伸展四肢。拉开了窗帘，光线照到桌上一幅「那一天」的集体照上。随后他在「一路顺风，哥哥」的送别声下，骑上脚踏车出门，奔向那片初夏的青空……现在，冒险再度进化……